Diario del proyecto Флора России и Крыма | Flora of Russia and the Crimea

Archivos de Diario para septiembre 2021

01 de septiembre de 2021

Командный кубок России по фотофиксации растений 2021 года: 1/2 финала (4-6 сентября)

Дорогие друзья!

С 4 по 6 сентября пройдёт 1/2 финала Командного кубка России по фотофиксации дикорастущих растений на платформе iNaturalist 2021 года. Внимательно читайте регламент, в нём есть изменения по сравнению с прошлым годом и с 1/4 финала.

Настройка таксономических фильтров у региональных проектов завершена. Пожалуйста, сравните список исключаемых видов в настройках проекта вашего региона (например, https://www.inaturalist.org/projects/para-2-kurskaya-oblast-1-2-kubka-2021 ) и список видов в единственном сообщении журнала соответствующего проекта (https://www.inaturalist.org/projects/para-2-kurskaya-oblast-1-2-kubka-2021/journal ). Там возможны ошибки. Если вы обнаружили нестыковки, сообщите мне на почту botanik.seregin@gmail.com .

Пространственные фильтры у региональных проектов (пункт 5 регламента, по три муниципальных образования) готовы: https://www.inaturalist.org/places/exclusion-filter-for-1-4 (те же выделы, что и в 1/4 финала) и https://www.inaturalist.org/places/exclusion-filter-for-1-2 (плюс один для 1/2 финала в каждом субъекте).

РЕГЛАМЕНТ

1. По итогам предыдущего круга соревнований 4 региональных проекта разбиты на две пары. В пары объединены регионы, сопоставимые по уровню активности в период проведения 1/4 финала. Сетка соревнований на основе числа наблюдений, сделанных в 1/4 финала (см. число после названия региона, дано справочно), выглядит следующим образом:

Пара 1
Крым 4342
Брянская область 1725

Пара 2
Курская область 756
Калужская область 614

2. Сделанные в природе в течение трёх дней (4, 5 и 6 сентября 2021 г.) новые наблюдения сосудистых растений России из соответствующих регионов, добавленные в iNaturalist, будут идти в зачёт соревнований. Для этого организован специальный проект-зонтик и 4 соответствующих биоблиц-проекта. Участники 1/2 финала должны подписаться на свой региональный биоблиц-проект - только их наблюдения по автоматическим фильтрам будут идти в зачёт соревнований. Нажатие кнопки "Присоединиться" на странице регионального биоблиц-проекта означает согласие с настоящим регламентом.

3. Таким образом, в зачёт соревнований будут добавляться только свежие наблюдения, сделанные в природе за три дня проведения соревнований. В зачёт идут только наблюдения, отвечающие требованиям проектов "Флора России | Flora of Russia" (наблюдения с "Исследовательским статусом") и "Flora of Russia: needs ID backlog" (наблюдения со статусом "Требуется идентификация") и, в связи с этим, попавшие в них автоматически. К наблюдениям предъявляются все обычные требования. С типовыми ошибками, которых следует избегать, следует ознакомиться здесь: https://www.inaturalist.org/projects/flora-of-russia?tab=about . Культурные растения в зачёт не идут. В связи со значительной протяжённостью нашей страны с запада на восток для корректного отображения статистики и избежания спорных ситуаций участникам настоятельно рекомендуется:
- установить на фотоаппарате/смартфоне, которыми будет производиться съёмка, поясное время своего региона, корректную дату и корректное время;
- не редактировать при загрузке дату и время съёмки для возможности верифицировать маршрут участников в течение дня;
- загружать фотографии, а не скриншоты фотографий (в которых отсутствуют корректное время и место съемки).
Установленная вручную дата съёмки, сбитое или неуказанное время съёмки может привести: (1) к непопаданию наблюдения в региональный биоблиц-проект по автоматическим фильтрам; (2) к отрицательной отметке на панели "Оценка качества данных" в разделе "Дата является точной" (что переведет наблюдение в категорию "обыкновенных" и не позволит получить ему "исследовательский статус").

4. В региональных биоблиц-проектах установлены фильтры для 8% самых регистрируемых видов флоры каждого региона (по данным на 21:30 MSK 31 августа 2021 г.). Их наблюдения не будут идти в зачёт 1/2 финала и учитываться в статистике на табло. Списки таких видов можно посмотреть в настройках региональных биоблиц-проектов. По регионам число незачётных видов, таким образом, следующее:

Пара 1
Крым - 150 (всего 1874)
Брянская область - 96 (всего 1202)

Пара 2
Курская область - 99 (всего 1240)
Калужская область - 64 (всего 794)

5. В региональных биоблиц-проектах установлен фильтр для трёх самых насыщенных наблюдениями муниципальных образования первого уровня (по данным массива данных iNaturalist на 26.08.2021, показатель плотности наблюдений на 1 кв. км). Наблюдения с их территории не будут идти в зачёт 1/2 финала и учитываться в статистике на табло. Эти районы можно будет посмотреть в настройках региональных проектов. Их список таков:

Крым: городской округ Ялта (39 наблюдений на 1 кв. км)
Крым: городской округ Феодосия (37 наблюдений на 1 кв. км)
Крым: городской округ Алушта (30 наблюдений на 1 кв. км)
Брянская область: городской округ Брянск (87 наблюдений на 1 кв. км)
Брянская область: городской округ Сельцо (42 наблюдения на 1 кв. км)
Брянская область: городской округ Фокино (14 наблюдений на 1 кв. км)
Курская область: городской округ Железногорск (91 наблюдение на 1 кв. км)
Курская область: городской округ Курск (35 наблюдений на 1 кв. км)
Курская область: Железногорский район (12 наблюдений на 1 кв. км)
Калужская область: городской округ Обнинск (12 наблюдений на 1 кв. км)
Калужская область: городской округ Калуга (2,5 наблюдения на 1 кв. км)
Калужская область: Юхновский район (1,6 наблюдений на 1 кв. км)

6. В течение вторника (7 сентября 2021 г.) можно будет добавить наблюдения, сделанные за предыдущие три дня. Результаты 1/2 финала будут объявлены вечером во вторник 7 сентября 2021 г. не ранее 20:00 MSK (по мере загрузки технических результатов) на странице https://www.inaturalist.org/projects/flora-of-russia/journal . Для получения автоматических уведомлений необходимо стать подписчиком проекта https://www.inaturalist.org/projects/flora-of-russia .

7. Победителем в паре будет признана команда, которая опередит оппонента на табло по двум показателям: как (1) по числу наблюдений, так и (2) по числу видов. При победе только в одной категории (или по числу видов, или по числу наблюдений) победителем будет признан регион, у которого к вечеру вторника 7 сентября 2021 г. будет выше общее число наблюдений от топ-пяти участников команды, отсортированных по числу найденных видов (если число участников в команде 5 человек или менее, берется сумма их наблюдений). Если рост данных приведёт к невозможности загрузки табло соревнований, то результаты будут обсчитаны с помощью csv-выгрузки.

8. Квалификационный норматив по числу наблюдений в 1/2 финала отсутствует. На следующей стадии предполагается розыгрыш финала и матча за третье место.

9. Организаторы и участники соревнований - это зарегистрированные участники платформы iNaturalist, которые добровольно согласились загружать туда свои наблюдения дикорастущих растений России (наблюдатели) и определять их (эксперты). Цель соревнований: содействовать научно точному сбору пространственных данных о флористическом разнообразии России и отдельных регионов в увлекательной форме.

Свои вопросы задавайте в комментариях. Постарайтесь максимально широко оповестить участников iNaturalist из своих регионов!

Небольшие новшества в регламенте Кубка этого года, подборка всех материалов прошлых лет и анонс календаря суммированы здесь.

Anotado en 01 de septiembre de 2021 a las 04:03 AM por apseregin apseregin | 4 comentarios | Deja un comentario

02 de septiembre de 2021

7500 видов !!!

Дорогие друзья!

В проекте "Флора России" на iNaturalist в первых числах августа счётчик вплотную подошёл к отметке в 7500 видов (https://www.inaturalist.org/projects/flora-of-russia/journal/55139-1-325-000). Это был отличный повод и неслабый вызов засесть за общий список видов проекта и прочистить его от ошибок и нестыковок всех мастей. Регулярно счётчик подпрыгивал то до 7520, то до 7524. Пожалуй, сегодня последний раз, когда нам удалось с этим справиться: около 17:30 MSK 2 сентября 2021 г. после очередного цикла чистки данных счётчик застыл на отметке 7499 видов.

Видом № 7500 в нашем проекте стала Pilosella kebeshensis (Stepanov) N.N.Tupitzina, только что добавленная в базу. Это наблюдение https://www.inaturalist.org/observations/93347235 Петра Косачёва (@petr_kosachev), сделанное в Красноярском крае.


Подробнее о процедурах чистки данных.

Причины ошибок самые разные. Пожалуй, перечислю все подряд без оценки того, какая дает максимальный вклад:

  • не отмеченное галочкой (как наблюдателями, так и экспертами) растение, снятое в культуре;
  • созвучность русских названий двух видов;
  • тупое подтверждение всего подряд, в т.ч. ошибок искусственного интеллекта и неопытных пользователей;
  • изменения в номенклатуре (все наблюдения перенесены куда надо, а появляется свеженькое со старым названием);
  • честное, но неправильное определение.

Для чистки есть несколько инструментов. Главный - утилита выкачивания списка видов проекта (автор Константин Романов): https://kildor.name/inat/species . С ее помощью узнаем, в частности, какие виды имеют пока по 1-2 проверенным наблюдениям по флоре России. Именно среди них наиболее возможны разные несистемные ошибки. Таких видов сейчас около 1,5 тыс. Можно пролистать их перечень и проверить то, что цепляется взглядом. Очень эффективно при первичной чистке после долгого перерыва.

Вторая утилита - "Новые виды в проекте" (https://kildor.name/inat/new-species). Помогает регулярно просматривать новые загрузки за любой период, но не работает, если кто-то решил поопределять (ну, или "поопределять") давно зависшие наблюдения.

Для этого есть другой способ. Общий список видов проекта можно скачать и сравнивать эталонную однажды подчищенную версию (см. конец поста) с новой полной выгрузкой. Сразу видна вся свежая активность: по загрузкам из интересных мест (сейчас пошли наблюдения из Тувы от @pyakai ), по работе знатоков отдельных групп (@alchemillist смотрит сейчас манжетки) и проч. Все остальные новости подлежат проверке и устранению неизбежных ошибок.

Четвертая опция: сравниваем список видов проекта и список культурных видов из "серой зоны". Наиболее заметные (как правило в процентах) перевесы в сторону находок в культуре дают перечень того, что надо аккуратно проверить в основном проекте на предмет того снято ли растение на грядке или всё же на свалке. Особое внимание именно единичным находкам (например, регулярно всплывает тюльпанное дерево или магнолии, не помеченные как культурные). Если на фото обстановка неясна, то на спутниковом снимке дачные участки видны отлично.

Пятая опция: проверка таксонов с единственной находкой против списка видов из модели автоматического определения (есть у меня такой, сделал сам очень хитрым маневром - официально он не публикуется). Сейчас таких видов было 132 штуки. Проверяем каждый. Среди этих растений вероятность найти результаты шалостей кнопконажимателей всех мастей на порядок выше.

Ну, и все вышеописанные процедуры делаем регулярно, пропалывая флору России от ошибок и некомпетентности.

PS. Всё описанное выше можно делать и в рамках региональных проектов, к чему и призываю наших замечательных знатоков местных флор.

PPS. Ссылка на условно чистый csv-файл с 7499 видами: https://vk.com/doc10828577_608610444

Anotado en 02 de septiembre de 2021 a las 03:53 PM por apseregin apseregin | 0 comentarios | Deja un comentario

04 de septiembre de 2021

1 425 000 !!!

Дорогие друзья! Dear all!
Небольшая напоминалка: после табличек в конце поста есть дайджест основных событий. Не забудьте с ним ознакомиться!
На счётчике сегодня 1 425 000 наблюдений в проекте "Флора России"! Для очередных 25 тыс. наблюдений нашему сообществу потребовалось 7 дней и 4,5 часа (в прошлый раз на 50 тысяч ушло чуть меньше 11 дней). За последние 8 дней число наблюдателей флоры России выросло на 108 человек, а число выявленных и подтверждённых видов увеличилось на 16 таксонов. Мы прошли две важные отметки: 7500 видов и 2200 подписчиков проекта.
We've got another milestone on the counter - 1,425,000 observations in the "Flora of Russia" project! For the 25-thousandth mark, our community spent ca. 7 days (comparing to ca. 11 days for previous 50K). During these days, the number of observers of the flora of Russia increased by 108 folks. We've got 16 new identified and confirmed species. Two other milestones are noteworthy, i.e. 7,500 species and 2,200 project members.
За последние 8 суток сразу 578 человек из 15,8 тыс. наблюдателей смогли выйти на улицу, сделать хотя бы одно наблюдение в природе и загрузить его на iNaturalist. В этот раз доля свежих полевых наблюдений составила 49% (против 51%, поступивших из ранних архивов пользователей или вытащенных экспертами из бэклога).
Over the past 8 days, 578 people have been able to go outside, make at least a single observation in nature and upload it to iNaturalist. This time, the proportion of fresh field observations was 49% versus 51% that came from early archives or pulled by the experts from the backlog.
Давайте снова зафиксируем статистику для истории.
1 425 000 наблюдений наш проект достиг 3 сентября 2021 г. в 22:39 MSK.
The project reached 1,425,000 observations in September 3, 2021 at 22:39 MSK.
● Статистика проекта | Project stats:
1 425 324 наблюдений - 7 509 видов - 5 872 эксперта - 15 818 наблюдателей
● Статистика бэклога | Backlog stats:
281 170 наблюдений - 6 859 видов - 2 187 экспертов - 11 312 наблюдателей
● Статистика по культурным растениям | Stats on cultivated plants:
98 932 наблюдения - 4 385 видов - 1 883 эксперта - 13 321 наблюдатель
● Статистика забракованных данных | Stats of gray zone (bad data):
12 164 наблюдения - 2 176 видов - 659 экспертов - 2 993 наблюдателя
С прошлого замера проект вырос на 26,8 тыс. наблюдений, а антипроект вырос на 6,1 тыс. наблюдений.

Проект "Флора России | Flora of Russia" на платформе iNaturalist прошёл отметку в 1 млн наблюдений, а незадолго до этого достиг технологического потолка платформы: примерно в середине марта главная страница портала перестала загружаться, сейчас её работа нестабильна. Мы решили перевернуть страницу и сделать небольшой ребрендинг!

Новый проект имеет очень простую структуру и позволяет быстро смотреть базовую статистику. Подписывайтесь на старый проект (более 2000 подписчиков), чтобы получать новости.

Ссылки:

Традиционные таблички даны ниже. Зачёт регионов по числу видов временно не будет публиковаться.

1. Самые активные участники (число наблюдений) | Top-observers (number of observations)

Место | Rank Пользователь | User Наблюдений | Observations Видов | Species
1 @apseregin 45 558 2 203
2 @dni_catipo 19 378 989
3 @panasenkonn 17 587 1 120
4 @katerina_kashirina 17 539 1 408
5 @npz 14 684 675
6 @melodi_96 14 675 1 105
7 @taimyr 14 492 1 378
8 @velibortravoved 14 492 703
9 @vladimir_teplouhov 13 943 535
10 @svetlana-bogdanovich 13 762 1 452
11 @a-lapin 12 585 773
12 @eduard_garin 11 599 931
13 @smsergey 10 865 786
14 @ledum 10 767 2 053
15 @yaroslavmagazov 10 706 598
16 @vadim_prokhorov 10 574 1 195
17 @dryomys 10 374 790
18 @julia_shner 10 127 783
19 @convallaria1128 9 871 1 554
20 @sapsan 9 859 1 472
21 @nikolaydorofeev 9 806 830
22 @alex_iosipenko 9 604 603
23 @sokolkov2002 9 573 793
24 @alzov 9 416 865
25 @aleksandrebel 9 275 1 145
26 @allaverkhozina 9 272 994
27 @pavel_golyakov 9 020 967
28 @tatyanazarubo 8 372 748
29 @dinanesterkova 8 358 766
30 @olga2019kuryakova 8 284 555
31 @max_сarabus 8 214 584
32 @yurii_basov 7 762 760
33 @borisbolshakov 7 233 640
34 @svetlanakutueva 7 074 525
35 @anastasiiamerkulova 7 040 1 017
36 @olegdavydov 6 702 439
37 @alebedev 6 637 625
38 @aleks-khimin 6 606 723
39 @prokhozhyj 6 484 637
40 @ninacourlee 6 388 638

2. Самые активные участники (число видов) | Top-observers (number of species)

Место | Rank Пользователь | User Наблюдений | Observations Видов | Species
1 @apseregin 45 558 2 203
2 @ledum 10 767 2 053
3 @ramazan_murtazaliev 3 625 1 819
4 @convallaria1128 9 871 1 554
5 @sapsan 9 859 1 472
6 @svetlana-bogdanovich 13 762 1 452
7 @vvolkotrub 3 718 1 423
8 @mallaliev 5 741 1 412
9 @katerina_kashirina 17 539 1 408
10 @taimyr 14 492 1 378
11 @lenatara 4 950 1 353
12 @phlomis_2019 4 769 1 235
13 @svdudov 2 249 1 202
14 @vadim_prokhorov 10 574 1 195
15 @elenasuslova 4 759 1 161
16 @demons1312 2 157 1 157
17 @gen_ok 2 868 1 147
18 @aleksandrebel 9 275 1 145
19 @panasenkonn 17 587 1 120
20 @melodi_96 14 675 1 105
21 @mihail13 1 991 1 027
22 @anastasiiamerkulova 7 040 1 017
23 @petr_kosachev 2 703 1 003
24 @allaverkhozina 9 272 994
25 @dni_catipo 19 378 989
26 @dinasafina 4 029 979
27 @pyakai 1 685 976
28 @pavel_golyakov 9 020 967
29 @daba 4 242 957
30 @alopecurus 5 769 938
31 @eduard_garin 11 599 931
32 @birdchuvashia 4 487 924
33 @natalia_gamova 2 521 878
34 @vladimirarkhipov 1 759 873
35 @kildor 6 287 868
36 @alzov 9 416 865
37 @andreyefremov 2 273 851
38 @ocanire 4 010 848
39 @ev_sklyar 3 831 846
40 @nikolaydorofeev 9 806 830

3. Статистика региональных проектов (наблюдения) | Regional projects' stats (observations)

Место | Rank Проект | Project Наблюдений | Observations
1 Флора Подмосковья | Moscow Oblast Flora 127 727
2 Флора Москвы | Flora of Moscow 122 428
3 Флора Иркутской области | Irkutsk Oblast Flora 56 600
4 Флора Брянской области | Bryansk Oblast Flora 55 684
5 Флора Крыма | Flora of the Crimea 50 500
6 Флора Тульской области | Tula Oblast Flora 47 360
7 Флора Свердловской области | Sverdlovsk Oblast Flora 46 998
8 Флора Курской области | Kursk Oblast Flora 46 649
9 Флора Новосибирской области | Novosibirsk Oblast Flora 44 130
10 Флора Нижегородской области | Nizhny Novgorod Oblast Flora 37 959
11 Флора Алтайского края | Altai Krai Flora 34 865
12 Флора Мордовии | Flora of Mordovia 34 740
13 Флора Севастополя | Sevastopol Flora 34 553
14 Флора Воронежской области | Voronezh Oblast Flora 30 756
15 Флора Татарстана | Tatarstan Flora 28 597
16 Флора Челябинской области | Chelyabinsk Oblast Flora 28 149
17 Флора Омской области | Omsk Oblast Flora 27 104
18 Флора Башкирии | Bashkortostan Flora 26 710
19 Флора Владимирской области | Vladimir Oblast Flora 26 554
20 Флора Камчатки | Kamchatka Flora 25 973
21 Флора Чувашии | Chuvash Republic Flora 24 587
22 Флора Ярославской области | Yaroslavl Oblast Flora 24 299
23 Флора Краснодарского края | Krasnodar Krai Flora 22 733
24 Флора Калининградской области | Kaliningrad Oblast Flora 20 917
25 Флора Костромской области | Kostroma Oblast Flora 20 738
26 Флора Югры | Flora of Khanty-Mansi Autonomous Okrug 17 772
27 Флора Тверской области | Tver Oblast Flora 17 727
28 Флора Ленинградской области | Leningrad Oblast Flora 16 393
29 Флора Самарской области | Samara Oblast Flora 15 659
30 Флора Приморского края | Primorsky Krai Flora 14 874
31 Флора Санкт-Петербурга | St Petersburg Flora 14 874
32 Флора Тюменской области | Tyumen Oblast Flora 13 994
33 Флора Саратовской области | Saratov Oblast Flora 13 317
34 Флора Красноярского края | Krasnoyarsk Krai Flora 12 955
35 Флора Калужской области | Kaluga Oblast Flora 12 739
36 Флора Пензенской области | Penza Oblast Flora 12 560
37 Флора Дагестана | Dagestan Flora 12 064
38 Флора Белгородской области | Belgorod Oblast Flora 11 426
39 Флора Республики Алтай | Altai Republic Flora 11 321
40 Флора Пермского края | Perm Krai Flora 11 065
41 Флора Бурятии | Buryat Republic Flora 10 582
42 Флора Томской области | Tomsk Oblast Flora 10 461
43 Флора Кемеровской области | Kemerovo Oblast Flora 8 290
44 Флора Кировской области | Kirov Oblast Flora 7 990
45 Флора Рязанской области | Ryazan Oblast Flora 7 102
46 Флора Мурманской области | Murmansk Oblast Flora 5 917
47 Флора Волгоградской области | Volgograd Oblast Flora 5 826
48 Флора Ульяновской области | Ulyanovsk Oblast Flora 5 826
49 Флора Ставрополья | Stavropol Krai Flora 5 791
50 Флора Удмуртии | Udmurt Republic Flora 5 724
51 Флора Карелии | Flora of Karelia 5 511
52 Флора Ростовской области | Rostov Oblast Flora 5 319
53 Флора Новгородской области | Novgorod Oblast Flora 5 299
54 Флора Псковской области | Pskov Oblast Flora 5 253
55 Флора Ямало-Ненецкого АО | Flora of Yamalo-Nenets Autonomous Okrug 5 025
56 Флора Липецкой области | Lipetsk Oblast Flora 4 943
57 Флора Архангельской области | Arkhangelsk Oblast Flora 4 378
58 Флора Карачаево-Черкесии | Flora of Karachay-Cherkessia 4 163
59 Флора Тамбовской области | Tambov Oblast Flora 4 043
60 Флора Сахалинской области | Sakhalin Oblast Flora 3 842
61 Флора Марий Эл | Mari El Flora 3 778
62 Флора Курганской области | Kurgan Oblast Flora 3 315
63 Флора Хакасии | Flora of Khakassia 3 254
64 Флора Смоленской области | Smolensk Oblast Flora 3 155
65 Флора Амурской области | Amur Oblast Flora 3 057
66 Флора Магаданской области | Magadan Oblast Flora 2 928
67 Флора Вологодской области | Vologda Oblast Flora 2 869
68 Флора Ивановской области | Ivanovo Oblast Flora 2 836
69 Флора Оренбургской области | Orenburg Oblast Flora 2 713
70 Флора Северной Осетии | Flora of North Ossetia 2 594
71 Флора Забайкальского края | Zabaykalsky Krai Flora 2 474
72 Флора Астраханской области | Astrakhan Oblast Flora 2 213
73 Флора Якутии | Flora of Yakutia 2 116
74 Флора Коми | Komi Republic Flora 1 732
75 Флора Адыгеи | Flora of Adygea 1 700
76 Флора Кабардино-Балкарии | Flora of Kabardino-Balkaria 1 683
77 Флора Орловской области | Oryol Oblast Flora 1 402
78 Флора Чукотки | Flora of Chukotka 1 308
79 Флора Хабаровского края | Khabarovsk Krai Flora 1 048
80 Флора Тувы | Tyva Republic Flora 808
81 Флора Калмыкии | Flora of Kalmykia 584
82 Флора Чечни | Chechen Republic Flora 375
83 Флора Еврейской АО | Flora of Jewish Autonomous Oblast 289
84 Флора Ненецкого АО | Flora of Nenets Autonomous Okrug 177
85 Флора Ингушетии | Flora of Ingushetia 72

4. Топ-наблюдатели за 8 дней (по числу видов) | 8-days top-observers (species)

Место | Rank Пользователь | User Наблюдений | Observations Видов | Species
1 @apseregin 541 473
2 @sapsan 455 311
3 @melodi_96 451 249
4 @anastasiiamerkulova 316 238
5 @urij777 307 228
6 @svetlana-bogdanovich 386 205
7 @disertinsky 332 178
8 @lilia_efimtseva 422 168
9 @lenatara 245 165
10 @nellysemenova 262 164
11 @julia_shner 172 160
12 @panasenkonn 209 157
13 @mariiaarkh 257 148
14 @katerina_kashirina 447 142
15 @prokhozhyj 237 138
16 @smsergey 187 138
17 @goncholgaj 245 137
18 @aleksey_baushev 138 133
19 @marina_sad 134 131
20 @zibzap 180 131
21 @kiramarch 130 126
22 @aleks-khimin 219 124
23 @tbsilaeva 164 123
24 @anatolipomortsev 176 115
25 @cambala 232 114
26 @elena_tikhonova 163 114
27 @wrrite 152 107
28 @convallaria1128 116 103
29 @osting 126 100
30 @tatiana_moscow 101 100
31 @vadim_prokhorov 304 96
32 @biflab 111 92
33 @arepieva 97 90
34 @elena526 93 86
35 @timakuzin 96 86
36 @dmitrydubikovskiy 120 85
37 @naturalist29626paterikina 109 84
38 @dmitriy_kuklin-volfson 98 81
39 @naturalist57011 95 80
40 @windof 98 74

5. Топ-поставщики видов за 8 дней (поле + архив) | 8-days top species uploaders (field & archives)

Место | Rank Пользователь | User Наблюдений | Observations Видов | Species
1 @apseregin 541 473
2 @sapsan 455 311
3 @melodi_96 451 249
4 @anastasiiamerkulova 316 238
5 @urij777 329 234
6 @svetlana-bogdanovich 387 206
7 @convallaria1128 284 202
8 @pyakai 248 196
9 @vadim_prokhorov 1 048 189
10 @gen_ok 281 186
11 @ocanire 187 180
12 @disertinsky 332 178
13 @lilia_efimtseva 428 171
14 @lenatara 246 166
15 @nellysemenova 262 164
16 @petr_kosachev 299 162
17 @julia_shner 173 160
18 @panasenkonn 209 157
19 @smsergey 221 150
20 @mariiaarkh 257 148
21 @prokhozhyj 285 148
22 @katerina_kashirina 447 142
23 @dni_catipo 359 139
24 @goncholgaj 245 137
25 @aleksey_baushev 138 133
26 @marina_sad 134 131
27 @zibzap 180 131
28 @elena_tikhonova 188 128
29 @kiramarch 130 126
30 @veronika_belova 257 125
31 @aleks-khimin 220 124
32 @tbsilaeva 164 123
33 @elenasuslova 181 120
34 @wrrite 166 120
35 @anatolipomortsev 176 115
36 @cambala 232 114
37 @osting 126 100
38 @tatiana_moscow 101 100
39 @mitrula_paludosa 251 98
40 @svetlanakutueva 212 97

6. Самые активные эксперты для загруженных за 8 дней наблюдений (поле + архив) | Top-experts for the last 8-days uploads (field & archives)

Место | Rank Пользователь | User Определений | IDs
1 @igor_kuzmin 2 105
2 @convallaria1128 1 494
3 @phlomis_2019 1 366
4 @julia_shner 1 343
5 @apseregin 1 019
6 @madmanserg 909
7 @svetlana-bogdanovich 849
8 @daba 648
9 @aleks-khimin 590
10 @panasenkonn 510
11 @mallaliev 479
12 @lenatara 406
13 @spins 324
14 @vladimirbakutov 303
15 @smsergey 295
16 @mihail13 269
17 @brodaga59 235
18 @eduard_garin 222
19 @jules_f 220
20 @svg52 173
ТЕКУЩИЕ ТЕМЫ:
● Продожается наш традиционный Командный кубок! В субботу стартует 1/2 финала (4-6 сентября 2021 г.), а значит он вызовет интерес всего в четырех регионах. До полуфинала дошли только Брянская область, Калужская область, Крым и Курская область. Всё внимание на табло соревнований и регламент! На этом этапе в зачёт будут идти ТОЛЬКО наблюдения подписчиков соответствующих региональных биоблицев. Небольшие новшества в регламенте этого года, подборка всех материалов прошлых лет и анонс календаря здесь. В следующие выходные - финал и матч за третье место. Команды-полуфиналисты, готовьтесь к бою!
● Вышла новая модель автоматического распознавания видов iNaturalist. Она включает около 38 000 видов, в т.ч. 2680 видов флоры России. Для того, чтобы привлечь ваше внимание к видам, которые в ближайшие месяцы могут дополнить модель, мы запустили копилку "Флоры России" - в ней собраны данные по 300 видам-кандидатам. По этим растениям нужно набрать минимум 100 наблюдений. Виды в копилке постоянно обновляются, чтобы было веселее: так, за неделю еще 14 видов прошли пороговую отметку и были заменены. Присоединяйтесь!
● С 1 марта 2021 г. стартовал конкурс "Белые пятна" для стимулирования сбора данных по флоре отстающих регионов. Опубликовано официальное положение конкурса. В нём принимают участие наблюдения сосудистых растений из следующих регионов: Еврейская АО, Ингушетия, Калмыкия, Магаданская область, Ненецкий АО, Северная Осетия, Тува, Хабаровский край, Чукотка, Якутия. Приём заявок закрыт, в октябре подведём итоги. Конкурс проводится в личном зачёте: участвует 14 человек. Предполагается денежный приз.
● На платформе iNaturalist есть очень красочная тепловая карта данных нашего проекта. На этой карте легко посмотреть, куда стоит поехать, чтобы равномерно собрать данные для "Атласа флоры России".
● Для статистической и пространственной обработки данных подоспел свежий бэкап проекта: семь гигантских xlsx-таблиц.
● Проекту в январе 2021 г. исполнилось два года! В честь небольшого юбилея, мы сделали дайджест основных событий в виде интерактивного оглавления. Например, там собраны все инструкции по разным аспектам жизни портала, опубликованные в журнале. Надеюсь, будет интересно!
● Приглашаем всех участников iNaturalist подписываться не только на проект МГУ "Флора России", но и на региональные страницы этого портала, на антипроект (бэклог) и "серую зону". В паспорте каждого наблюдения будет, таким образом, отражена как ссылка на общероссийский проект (в т.ч. ещё до определения или при съемке культурных растений), так и региональная принадлежность наблюдения. О том, что такое "серая зона", написано в специальном посте.
Для написания данного поста использован конвертер текстовых и табличных данных, который осуществляет разметку текста. Конвертер разработал Константин Романов (@kildor). Если у вас есть свои проекты, то вам эта ссылка, уверен, пригодится!
Anotado en 04 de septiembre de 2021 a las 04:26 AM por apseregin apseregin | 0 comentarios | Deja un comentario

05 de septiembre de 2021

1/2 Кубка: новости второго дня

Дорогие друзья!

В 0:00 часов по местному времени 4 сентября стартовала 1/2 финала Командного кубка России по фотофиксации растений 2021 года. Участвуют 4 региональных проектов "Флоры России", разбитые на четыре пары. Внимательно читайте регламент.

Благодаря активной работе региональных сообществ до этого этапа дошли следующие команды: Брянская область, Калужская область, Крым, Курская область. Найдите в специальном проекте-зонтике 1/2 финала свой регион и вступайте в команду - ещё не поздно присоединиться. Не забывайте: на этом этапе в зачёт будут идти только наблюдения подписчиков соответствующих региональных биоблицев.

Командный кубок России по фотофиксации дикорастущих растений на платформе iNaturalist - крупнейшее событие нашего сообщества. Так, только за один первый день 1/16 финала (14 августа 2021 г.) был поставлен суточный рекорд по числу наблюдений из России. В этот день было сделано 20,7 тыс. наблюдений, в том числе 17,4 тыс. наблюдений сосудистых растений.

Итоги второго дня таковы. На 20:30 MSK 5 сентября 2021 г. были загружены 1 372 наблюдения по 588 видам от 12 наблюдателей, попадающие в зачёт 1/2 финала Командного кубка России по фотофиксации растений 2021 года. Последние два дня Среднюю Россию терзали дожди. Что ж, посмотрим, что будет завтра и во вторник. Всем удачных стартов!

Официальный протокол:

НАБЛЮДЕНИЯ

Позиция Проект Количество
1 Пара 1: Крым, 1/2 Кубка-2021 749
2 Пара 1: Брянская область, 1/2 Кубка-2021 428
3 Пара 2: Курская область, 1/2 Кубка-2021 195
4 Пара 2: Калужская область, 1/2 Кубка-2021 0

ВИДЫ

Позиция Проект Количество
1 Пара 1: Крым, 1/2 Кубка-2021 356
2 Пара 1: Брянская область, 1/2 Кубка-2021 232
3 Пара 2: Курская область, 1/2 Кубка-2021 119
4 Пара 2: Калужская область, 1/2 Кубка-2021 0

УЧАСТНИКИ

Позиция Проект Количество
1 Пара 1: Брянская область, 1/2 Кубка-2021 5
2 Пара 1: Крым, 1/2 Кубка-2021 4
3 Пара 2: Курская область, 1/2 Кубка-2021 3
4 Пара 2: Калужская область, 1/2 Кубка-2021 0

НАБЛЮДАТЕЛИ

Место Наблюдатель Наблюдений Видов
1 @lenatara 268 196
2 @svetlana-bogdanovich 260 161
3 @kiramarch 194 109
4 @cambala 155 90
5 @tatyaya 137 85
6 @panasenkonn 91 79
7 @urij777 72 66
8 @katerina_kashirina 66 43
9 @alina_klu 48 40
10 @lilia_efimtseva 45 32
11 @disertinsky 23 18
12 @arepieva 13 13
Anotado en 05 de septiembre de 2021 a las 05:32 PM por apseregin apseregin | 0 comentarios | Deja un comentario

06 de septiembre de 2021

1/2 Кубка: новости третьего дня

Дорогие друзья!

В 23:59 часов по местному времени 6 сентября заканчивается полевая часть 1/2 финала Командного кубка России по фотофиксации растений 2021 года. Участвуют 4 региональных проектов "Флоры России", разбитые на четыре пары. Внимательно читайте регламент.

Благодаря активной работе региональных сообществ до этого этапа дошли следующие команды: Брянская область, Калужская область, Крым, Курская область. Следите в специальном проекте-зонтике 1/2 финала за подведением итогов.

Командный кубок России по фотофиксации дикорастущих растений на платформе iNaturalist - крупнейшее событие нашего сообщества. Так, только за один первый день 1/16 финала (14 августа 2021 г.) был поставлен суточный рекорд по числу наблюдений из России. В этот день было сделано 20,7 тыс. наблюдений, в том числе 17,4 тыс. наблюдений сосудистых растений.

Итоги второго дня таковы. На 21:45 MSK 6 сентября 2021 г. были загружены 3 853 наблюдения по 979 видам от 15 наблюдателей, попадающие в зачёт 1/2 финала Командного кубка России по фотофиксации растений 2021 года. Завтра вечером будут подведены окончательные итоги.

Официальный протокол:

НАБЛЮДЕНИЯ

Позиция Проект Количество
1 Пара 1: Крым, 1/2 Кубка-2021 1 916
2 Пара 2: Курская область, 1/2 Кубка-2021 897
3 Пара 1: Брянская область, 1/2 Кубка-2021 674
4 Пара 2: Калужская область, 1/2 Кубка-2021 272

ВИДЫ

Позиция Проект Количество
1 Пара 1: Крым, 1/2 Кубка-2021 569
2 Пара 1: Брянская область, 1/2 Кубка-2021 321
3 Пара 2: Курская область, 1/2 Кубка-2021 320
4 Пара 2: Калужская область, 1/2 Кубка-2021 183

УЧАСТНИКИ

Позиция Проект Количество
1 Пара 1: Брянская область, 1/2 Кубка-2021 6
2 Пара 1: Крым, 1/2 Кубка-2021 4
3 Пара 2: Курская область, 1/2 Кубка-2021 4
4 Пара 2: Калужская область, 1/2 Кубка-2021 1

НАБЛЮДАТЕЛИ

Место Наблюдатель Наблюдений Видов
1 @svetlana-bogdanovich 779 325
2 @tatyaya 559 231
3 @cambala 407 189
4 @lenatara 370 255
5 @katerina_kashirina 360 127
6 @kiramarch 277 146
7 @anastasiiamerkulova 272 183
8 @lilia_efimtseva 122 64
9 @arepieva 114 85
10 @vladimirkurilo 103 92
11 @lex_deineko 102 48
12 @panasenkonn 91 79
13 @disertinsky 83 65
14 @urij777 72 66
15 @alina_klu 48 40
Anotado en 06 de septiembre de 2021 a las 06:48 PM por apseregin apseregin | 0 comentarios | Deja un comentario

07 de septiembre de 2021

Результаты 1/2 финала Командного кубка России по фотофиксации растений 2021 года

Дорогие друзья!

Выражаем глубокую благодарность участникам наших замечательных весёлых стартов! Командам-победителям и командам, которые в упорной борьбе уступили. Эксперты работали добровольно и сделали всё, что смогли за столь короткое время. Задача Кубка не спортивная, а научно-познавательная. Полученные за это время наблюдения постепенно будут проверены, многие из них определены и подтверждены.

Чистые победы по двум показателям одержали следующие два проекта:

Пара 1: Крым
Пара 2: Курская область

Таким образом, определены участники финала и матча за третье место Кубка-2021!

Финал
Крым
Курская область

Матч за третье место
Брянская область
Калужская область


Финал и матч за третье место состоятся с 11 по 13 сентября. Завтра будет опубликован регламент, но к региональным проектам и общероссийскому табло можно присоединяться уже сейчас. Настройки фильтров у проектов (будут исключены 10% видов и по 3 муниципальных образования первого уровня) требуют большой работы и будут готовы ближе к старту следующего этапа соревнований. Присоединяйтесь! Будет весело!

На 22:00 MSK 7 сентября 2021 г. были загружены 6 925 наблюдений по 1 216 видам от 20 наблюдателей из следующих регионов, попадающих в зачёт 1/2 финала Командного кубка России по фотофиксации растений 2021 года:

НАБЛЮДЕНИЯ

Позиция Проект Количество
1 Пара 1: Крым, 1/2 Кубка-2021 3 287
2 Пара 2: Курская область, 1/2 Кубка-2021 1 740
3 Пара 1: Брянская область, 1/2 Кубка-2021 1 167
4 Пара 2: Калужская область, 1/2 Кубка-2021 731

ВИДЫ

Позиция Проект Количество
1 Пара 1: Крым, 1/2 Кубка-2021 731
2 Пара 2: Курская область, 1/2 Кубка-2021 484
3 Пара 1: Брянская область, 1/2 Кубка-2021 417
4 Пара 2: Калужская область, 1/2 Кубка-2021 316

УЧАСТНИКИ

Позиция Проект Количество
1 Пара 1: Брянская область, 1/2 Кубка-2021 7
2 Пара 2: Курская область, 1/2 Кубка-2021 6
3 Пара 1: Крым, 1/2 Кубка-2021 5
4 Пара 2: Калужская область, 1/2 Кубка-2021 2

НАБЛЮДАТЕЛИ

Место Наблюдатель Наблюдений Видов
1 @sapsan 723 443
2 @svetlana-bogdanovich 1 230 417
3 @anastasiiamerkulova 587 296
4 @lenatara 369 257
5 @kiramarch 559 213
6 @tatyaya 562 211
7 @lilia_efimtseva 527 202
8 @cambala 405 188
9 @katerina_kashirina 560 182
10 @panasenkonn 226 172
11 @ev_sklyar 207 163
12 @zibzap 196 125
13 @disertinsky 130 98
14 @arepieva 148 94
15 @vladimirkurilo 103 92
16 @sansan_94 144 86
17 @urij777 72 66
18 @lex_deineko 100 48
19 @alina_klu 48 40
20 @izotkind 29 21
Anotado en 07 de septiembre de 2021 a las 07:00 PM por apseregin apseregin | 0 comentarios | Deja un comentario

08 de septiembre de 2021

Командный кубок России по фотофиксации растений 2021 года: финал и матч за третье место (11-13 сентября)

Дорогие друзья!

С 11 по 13 сентября пройдёт долгожданный финал Командного кубка России по фотофиксации дикорастущих растений на платформе iNaturalist 2021 года, а также матч за третье место. Внимательно читайте регламент, в нём есть изменения по сравнению с 1/2 финала.

Настройка таксономических фильтров у региональных проектов пока в работе. Начиная с 12:00 MSK 8.09.2021, пожалуйста, сравните список исключаемых видов в настройках проекта вашего региона (например, https://www.inaturalist.org/projects/kurskaya-oblast-final-kubka-2021 ) и список видов в единственном сообщении журнала соответствующего проекта (https://www.inaturalist.org/projects/kurskaya-oblast-final-kubka-2021/journal ). Там возможны ошибки. Если вы обнаружили нестыковки, сообщите мне на почту botanik.seregin@gmail.com .

Пространственные фильтры у региональных проектов (пункт 5 регламента, по три муниципальных образования) те же, что и полуфиналах. Вы можете посмотреть фильтры для прошлых стадий: https://www.inaturalist.org/places/exclusion-filter-for-1-4 (те же выделы, что и в 1/4 финала) и https://www.inaturalist.org/places/exclusion-filter-for-1-2 (плюс один для 1/2 финала в каждом субъекте).

РЕГЛАМЕНТ

1. По итогам предыдущего круга соревнований 4 региональных проекта разбиты на две пары: финал и матч за третье место. Сетка соревнований выглядит следующим образом:

Финал
Крым
Курская область

Матч за третье место
Брянская область
Калужская область

2. Сделанные в природе в течение трёх дней (11, 12 и 13 сентября 2021 г.) новые наблюдения сосудистых растений России из соответствующих регионов, добавленные в iNaturalist, будут идти в зачёт соревнований. Для этого организован специальный проект-зонтик и 4 соответствующих биоблиц-проекта. Участники должны подписаться на свой региональный биоблиц-проект - только их наблюдения по автоматическим фильтрам будут идти в зачёт соревнований. Нажатие кнопки "Присоединиться" на странице регионального биоблиц-проекта означает согласие с настоящим регламентом.

3. Таким образом, в зачёт соревнований будут добавляться только свежие наблюдения, сделанные в природе за три дня проведения соревнований. В зачёт идут только наблюдения, отвечающие требованиям проектов "Флора России | Flora of Russia" (наблюдения с "Исследовательским статусом") и "Flora of Russia: needs ID backlog" (наблюдения со статусом "Требуется идентификация") и, в связи с этим, попавшие в них автоматически. К наблюдениям предъявляются все обычные требования. С типовыми ошибками, которых следует избегать, следует ознакомиться здесь: https://www.inaturalist.org/projects/flora-of-russia?tab=about . Культурные растения в зачёт не идут. В связи со значительной протяжённостью нашей страны с запада на восток для корректного отображения статистики и избежания спорных ситуаций участникам настоятельно рекомендуется:
- установить на фотоаппарате/смартфоне, которыми будет производиться съёмка, поясное время своего региона, корректную дату и корректное время;
- не редактировать при загрузке дату и время съёмки для возможности верифицировать маршрут участников в течение дня;
- загружать фотографии, а не скриншоты фотографий (в которых отсутствуют корректное время и место съемки).
Установленная вручную дата съёмки, сбитое или неуказанное время съёмки может привести: (1) к непопаданию наблюдения в региональный биоблиц-проект по автоматическим фильтрам; (2) к отрицательной отметке на панели "Оценка качества данных" в разделе "Дата является точной" (что переведет наблюдение в категорию "обыкновенных" и не позволит получить ему "исследовательский статус").

4. В региональных биоблиц-проектах установлены фильтры для 10% самых регистрируемых видов флоры каждого региона (по данным на 11:00 MSK 8 сентября 2021 г.). Их наблюдения не будут идти в зачёт финала и матча за третье место и учитываться в статистике на табло. Списки таких видов можно посмотреть в настройках региональных биоблиц-проектов. По регионам число незачётных видов, таким образом, следующее:

Пара 1
Крым - 188 (всего 1883)
Курская область - 125 (всего 1246)

Пара 2
Брянская область - 121 (всего 1207)
Калужская область - 82 (всего 815)

5. В региональных биоблиц-проектах установлен фильтр для трёх самых насыщенных наблюдениями муниципальных образования первого уровня (по данным массива данных iNaturalist на 26.08.2021, показатель плотности наблюдений на 1 кв. км). Наблюдения с их территории не будут идти в зачёт финала и матча за третье место и учитываться в статистике на табло. Эти районы можно будет посмотреть в настройках региональных проектов. Их список таков:

Крым: городской округ Ялта (39 наблюдений на 1 кв. км)
Крым: городской округ Феодосия (37 наблюдений на 1 кв. км)
Крым: городской округ Алушта (30 наблюдений на 1 кв. км)
Курская область: городской округ Железногорск (91 наблюдение на 1 кв. км)
Курская область: городской округ Курск (35 наблюдений на 1 кв. км)
Курская область: Железногорский район (12 наблюдений на 1 кв. км)
Брянская область: городской округ Брянск (87 наблюдений на 1 кв. км)
Брянская область: городской округ Сельцо (42 наблюдения на 1 кв. км)
Брянская область: городской округ Фокино (14 наблюдений на 1 кв. км)
Калужская область: городской округ Обнинск (12 наблюдений на 1 кв. км)
Калужская область: городской округ Калуга (2,5 наблюдения на 1 кв. км)
Калужская область: Юхновский район (1,6 наблюдений на 1 кв. км)

6. В течение вторника (14 сентября 2021 г.) можно будет добавить наблюдения, сделанные за предыдущие три дня. Результаты финала и матча за третье место будут объявлены вечером во вторник 14 сентября 2021 г. не ранее 20:00 MSK (по мере загрузки технических результатов) на странице https://www.inaturalist.org/projects/flora-of-russia/journal . Для получения автоматических уведомлений необходимо стать подписчиком проекта https://www.inaturalist.org/projects/flora-of-russia .

7. Победителем в паре будет признана команда, которая опередит оппонента на табло по двум показателям: как (1) по числу наблюдений, так и (2) по числу видов. При победе только в одной категории (или по числу видов, или по числу наблюдений) победителем будет признан регион, у которого к вечеру вторника 14 сентября 2021 г. будет выше общее число наблюдений от топ-пяти участников команды, отсортированных по числу найденных видов (если число участников в команде 5 человек или менее, берется сумма их наблюдений). Если рост данных приведёт к невозможности загрузки табло соревнований, то результаты будут обсчитаны с помощью csv-выгрузки.

8. Организаторы и участники соревнований - это зарегистрированные участники платформы iNaturalist, которые добровольно согласились загружать туда свои наблюдения дикорастущих растений России (наблюдатели) и определять их (эксперты). Цель соревнований: содействовать научно точному сбору пространственных данных о флористическом разнообразии России и отдельных регионов в увлекательной форме.

Удачи!

Anotado en 08 de septiembre de 2021 a las 07:56 AM por apseregin apseregin | 1 comentario | Deja un comentario

10 de septiembre de 2021

Свежие данные GBIF (7 сентября 2021 г.)

Дорогие друзья!

Постепенно к сообществу проекта "Флора России" присоединяются всё новые пользователи. Изредка мы рассказываем о том, как взаимодействуют iNaturalist и GBIF. Пост месячной давности тут: https://www.inaturalist.org/projects/flora-of-russia/journal/54285-svezhie-dannye-gbif-10-avgusta-2021-g-rossiya-uzhe-na-vtorom-meste

Итак, Global Biodiversity Information Facility (https://www.gbif.org/) - это глобальная платформа-агрегатор данных о биоразнообразии. Их здесь очень много: 1 891 669 564 фактов присутствия того или иного вида в той или иной точке. Это и наблюдения, и образцы, и окаменелости, и данные литературы. Чтобы все эти данные оказались доступны в одном месте, 1728 организаций по всему миру объединили здесь свои 62 158 баз данных - больших и малых. Российские организации (университеты, академические институты, музеи, ООПТ) опубликовали в GBIF 515 баз данных.

Любой пользователь может освоить несложную поисковую систему GBIF (https://www.gbif.org/occurrence/search) и найти то, что ему интересно. Система поисковых фильтров GBIF отличается богатым выбором настроек и стремительным отображением результатов, несмотря на гигантские объемы данных. Мой опыт показывает, что искать здесь отдельные наблюдения гораздо быстрее, чем на iNaturalist. Кроме того, удобно, следуя гиперссылкам, исправлять определение какой-нибудь случайной ошибки из числа наблюдений iNat, прошедших в GBIF.

Конечно, среди баз данных о биоразнообразии есть очень большие массивы! Вот, как выглядит сейчас десятка самых больших:

1) EOD – eBird Observation Dataset 872 206 403
2) Artportalen (Swedish Species Observation System) 82 017 115
3) Observation.org, Nature data from around the World 39 969 765
4) iNaturalist Research-grade Observations 33 164 781
5) DOF - Observations from the Danish Ornithological Society 27 299 760
6) Norwegian Species Observation Service 25 804 122
7) INPN - Données flore des CBN agrégées par la FCBN 20 999 334
8) Southern African Bird Atlas Project 2 17 692 560
9) Waarnemingen.be - Bird occurrences in Flanders and the Brussels Capital Region, Belgium 12 811 851
10) NSW BioNet Atlas 12 642 938

А вот как выглядит другая десятка - с данными по сосудистым растениям.

1) INPN - Données flore des CBN agrégées par la FCBN 20 960 245
2) Artportalen (Swedish Species Observation System) 14 230 807
3) iNaturalist Research-grade Observations 12 635 392
4) Dutch Vegetation Database 11 108 843
5) The Danish Environmental Portal, species and habitats-database "Danmarks Miljøportals Naturdatabase" 10 817 674
6) Pl@ntNet automatically identified occurrences 9 634 639
7) Flora von Deutschland (Phanerogamen) 9 197 488
8) BSBI data from several English counties, up to 2015 8 158 299
9) Flore du Bassin parisien (CBNBP) 7 781 816
10) Floristic records from survey studies of the Bayerisches Landesamt für Umwelt 7 112 618

Как видно из обоих списков, данные из iNaturalist являются одним из ведущих источников данных в GBIF - как по всем группам живых организмов (4-е место), так и по сосудистым растениям (3-е место). И эти данные постоянно растут. По прогнозам и динамике, iNat выйдет на второе место по сосудистым растениям уже в этом году, а в следующем году станет первым.

На iNaturalist 79,5 млн наблюдений, а в GBIF попадает лишь 33,2 млн (https://doi.org/10.15468/ab3s5x). Почему? Дело в том, что одновременно:

  • наблюдение должно иметь исследовательский статус;
  • наблюдение должно иметь открытую лицензию (CC0, CC-BY, CC-BY-NC);
  • а сами данные при этом публикуются с задержкой (сейчас данные от 27.08.2021).

Давайте сравним две ссылки на одно и то же наблюдение:

https://www.gbif.org/occurrence/3017963860
https://www.inaturalist.org/observations/67518248

Автор не указал своего полного имени в профиле, поэтому в GBIF он числится как "Denis". Так что стоит указать полное имя в профиле в соответствующем разделе (лучше латиницей!). Автором определения значится в GBIF Игорь Поспелов, поскольку он первый указал правильное название вида. Ссылка на автора определения нормируется с помощью номера ORCID, который каждый пользователь может привязать в своем личном кабинете. В паспорте наблюдения на iNaturalist есть ссылка на GBIF ("Это наблюдение размещено на 1 сайте: GBIF"), обратная ссылка на сайте GBIF имеется с момента заливки.

У GBIF своя номенклатура, которая автоматически стыкуется с названиями iNat, а также имеется в расширенном поиске фильтр по автору находки, так что можете выбрать и посмотреть, какие ваши наблюдения попали в GBIF. Недавно там появился поиск по административным единицам (правда, карта заложена 10-летней давности, так что границы Москвы и Подмосковья, например, старые).

Если вы хотите, чтобы ваши наблюдения попали в GBIF, то необходимо удостовериться, что у вас выставлена открытая лицензия. Это можно сделать только через сайт (в приложении поменять лицензию нельзя). О том, как это сделать написано с иллюстрацией в этом посте: https://www.inaturalist.org/projects/flora-of-russia/journal/39331-obnovlen-massiv-dannyh-inaturalist-v-gbif-11-avgusta . Если у вас не проставлена лицензия, то в карточке каждого наблюдения у вас в правом нижнем углу написано "Все права защищены", если проставлена, то, как правило, - "Некоторые права защищены".

Отдельно отметим, что все топ-100 наблюдателей проекта "Флора России" перешли на свободные лицензии. Доля наблюдений проекта, заблокированных жёсткими лицензиями, сократилась сейчас до рекордной отметки в 10,5%! Это наше большое общее достижение в деле открытого доступа к данным о биоразнообразии. Большое спасибо, что не оставили без внимания предыдущие посты о GBIF. Возможно, в этот раз отклик будет еще шире.

Зачем всё это нужно?

Самый простой ответ заключается в том, что именно из GBIF исследователи выгружают данные о растениях, грибах и животных в удобном виде (csv-выгрузки). Каждая такая выгрузка получает doi, с помощью которого отслеживаются цитирования в научных исследованиях. Так, массив данных iNaturalist (https://doi.org/10.15468/ab3s5x ) процитирован через GBIF уже 1865 раз! Это рекорд среди всех участников GBIF.


ДОГОНЯЛКИ

Традиционно летом мы устраиваем догонялки с разными странами мира, глядя на оперативно обновляемые данные GBIF. В этом году по разным поводам мы догоняем Мексику и США.

= Цель 1: догнать Мексику по числу наблюдений сосудистых растений в GBIF (из всех баз) =

11) Belgium 9,784,254
12) Switzerland 7,279,677
13) Finland 7,231,233
14) Norway 6,335,460
15) Mexico 5,281,995
16) Russian Federation 3,462,863
17) Japan 3,230,672
18) Canada 3,000,314
19) Portugal 2,804,643
20) Colombia 2,504,699

Здесь отрывы гигантские, но отставание от Мексики неуклонно сокращается. Пока наше отставание 1,82 млн записей (месяц назад было 1,96 млн). В этом зачёте участвуют все источники информации, поступающие в GBIF. Российские учреждения регулярно публикуют новые данные по флоре России (прежде всего, оцифрованные гербарные коллекции), поэтому смотрим с надеждой на будущее.

= Цель 2: догнать США по числу наблюдений сосудистых растений из iNaturalist в GBIF на месячных отсечках =

Вот, что у нас получается за август 2021 г.:

1) United States of America 106 408
2) Russian Federation 59 111
3) Canada 31 048
4) United Kingdom 11 688
5) Australia 11 321

Пока отставание в 1,8 раза. В прошлом году мы сокращали его в некоторые месяцы до отметки в 1,6 раз. Посмотрим, что будет в сентябре.


На данный момент в GBIF индексируется уже 7,35 млн записей о биоразнообразии России - 7,17 млн с основной территории и 0,18 млн из Крыма. При этом, iNaturalist является самым большим по объему источником данных о природе России (занимает долю 25,4% по основной территории и 51,3% по Крыму). Эта доля постоянно растёт благодаря нашим усилиям.

Вот, какие массивы данных по биоразнообразию России являются крупнейшими сегодня:

1) iNaturalist Research-grade Observations 1 822 227
2) Moscow University Herbarium (MW) 659 566
3) RU-BIRDS.RU, Birds observations database from Russia and neighboring regions. Zoological Museum of M.V. Lomonosov Moscow State University. 488 907
4) EOD – eBird Observation Dataset 387 883
5) Geographically tagged INSDC sequences 195 451
6) Locations of plants on dot distribution maps in the Flora of Siberia (Flora Sibiraea, 1987–1997) 169 854
7) Flora of Vladimir Oblast, Russia: an updated grid dataset (1867–2020) 130 054
8) Finnish Floristic Database (Finnish Museum of Natural History Collections) 106 396
9) Birds of Northern Eurasia 86 992
10) L. IS dataset. Cyanoprocaryota, Lichens, Bryophyte 86 579

А вот, что есть в GBIF по сосудистым растениям России:

1) iNaturalist Research-grade Observations 1 178 912
2) Moscow University Herbarium (MW) 587 567
3) Locations of plants on dot distribution maps in the Flora of Siberia (Flora Sibiraea, 1987–1997) 169 854
4) Flora of Vladimir Oblast, Russia: an updated grid dataset (1867–2020) 130 054
5) Finnish Floristic Database (Finnish Museum of Natural History Collections) 106 082
6) Chronicle of Nature - Phenology of Plants of Zhiguli Nature Reserve 86 524
7) MHA Herbarium: collections of vascular plants 72 381
8) Pl@ntNet automatically identified occurrences 71 567
9) A global database for the distributions of crop wild relatives 69 255
10) Chronicle of Nature - Phenology of Plants of FSE Zapovednoe Podlemorye 54 792

P.S. Если у кого-то есть электронные таблицы с надёжными данными о встречах живых организмов, которые не пронзают на iNaturalist, то в принципе мы можем помочь с их публикацией в GBIF. Это могут быть данные геоботанических описаний, каталоги коллекций, флористические списки и проч. Пишите на почту botanik.seregin@gmail.com

Anotado en 10 de septiembre de 2021 a las 10:15 AM por apseregin apseregin | 7 comentarios | Deja un comentario

100 000 наблюдений из культуры !!!

Дорогие друзья!

У нас редкая круглая отметка - сегодня было отмечено галочкой "В культуре" ровно 100 000-ное наблюдение по флоре России.

Статистика по культурным растениям | Stats on cultivated plants:
100 006 наблюдений - 4 396 видов - 1 897 экспертов - 13 445 наблюдателей

Это замечательный повод рассказать о наблюдениях культурных растений на iNaturalist. Что скрывать: традиционно культурные растения (и животные в неволе) находятся вне области специализации платформы iNaturalist. Однако многие пользователи часто устанавливают приложение только для того, чтобы узнать, что растёт у них на даче, на подоконнике, в южном дендрарии или в цветочном магазине. Таких пользователей - тысячи, они не знают, что у iNat есть сайт, а на нём наш замечательный проект по флоре России. Собственно, поэтому поток таких наблюдений не ослабевает. Любое наблюдение растения, которое сделано в явной культуре (т.е. в том месте, где оно было посажено или с большой вероятностью посажено) должно обозначаться галочкой "В культуре". Обычно это должны делать сами пользователи, но многие поначалу об этом не догадываются.

Так что работа по простановке таких галочек ложится на плечи экспертов (точнее, ответственных экспертов), а также на движок самой платформы, который умеет автоматически обозначать культурные растения. Как это происходит?

Постепенно накапливается обширная статистика наблюдений. Если в системе появляется 5 наблюдений какого-либо рода из какого-нибудь региона (в нашем случае - субъекта федерации), то начинается отсчёт вероятностной статистики "в культуре / вне культуры". Если 80% наблюдений какого-либо рода (именно рода) - например, бегонии (Begonia) - в этом регионе отмечены как культурные, то все прочие наблюдения будут метиться галочкой "В культуре" автоматически. Автором этой галочки числится "iNaturalist". Соответственно, для таких наблюдений именно свойство "В культуре" выставляется по умолчанию, а чтобы это свойство поменять (например, вы сфотографировали не конский каштан на городской площади, а его проростки в тенистом парке) галочку "В культуре" вы снимаете вручную. Например, в Москве культурными по умолчанию считаются все спиреи, а в Санкт-Петербурге - все караганы.

Именно по этой причине мы очень редко видим в ленте неопределенных растений подавляющее большинство культурных растений. В последний год вполне надежно автоматически отмечаются как культурные почти все растения закрытого грунта, большинство многолетних культур, не склонных к натурализации, и заметное число летников. Этот прогресс по автоматической сортировке наблюдений достигнут именно потому, что ответственные пользователи (как наблюдатели, так и эксперты) долгое время ставили такие галочки вручную.

Но поскольку такая статистика считается на уровне родов, а не видов, то многие растения, имеющие диких сородичей в местной флоре автоматически не распознаются как культурные. Так что напомним еще раз: для культурных растений в нашем сообществе существует особый "шкафчик" и их обязательно надо отмечать галочкой во время загрузки или определения. Очень часто прямо на фотографии хорошо видно, что растение снято в палисаднике, на клумбе, на грядке, в ботсаду с табличкой, в садике у приморской гостиницы или в регулярном городском озеленении. Поэтому к этой работе легко могут подключаться те, кто не является автором фото. Продвинутые пользователи знают, что ускользающие из культуры растения стоит дополнительно снабжать описанием, что растение встречено в лесу или в виде проростков.

Впрочем и у экспертов, и у автоматического движка могут быть ошибки: в разделе "Ваши наблюдения" в фильтрах добавьте галочку "В неволе" и вы увидите все те свои наблюдения, которые на данный момент считаются на платформе сделанными в культуре.

Так что мы, как обычно, приглашаем всех участников iNaturalist подписываться не только на проект МГУ "Флора России", но и на региональные страницы этого портала, на антипроект (бэклог) и "серую зону", в которую и входят культурные растения России. В паспорте каждого наблюдения будет, таким образом, отражена как ссылка на общероссийский проект (в т.ч. ещё до определения или при съемке культурных растений), так и региональная принадлежность наблюдения. О том, что такое "серая зона", написано в специальном посте.

Пока же отметим самых активных наблюдателей культурных растений флоры России. Большое спасибо всем, кто ставит нужные галочки в нужных местах и не оставляет без внимания богатую культурную флору нашей страны!

Место Наблюдатель Наблюдений Видов
1 @ledum 2 321 572
2 @eduard_garin 2 158 520
3 @korotkov 1 284 257
4 @arina_orlova 822 76
5 @matveydoronin 723 61
6 @demons1312 675 421
7 @dmitriy_kuklin-volfson 643 248
8 @korobkov 591 61
9 @kosienkov_konstantin 542 157
10 @elenasad 532 113
11 @naturalist49367 529 204
12 @svg52 468 98
13 @alex_iosipenko 459 191
14 @ant0n 432 36
15 @viktoriabilous 427 129
16 @nikolai_nakonechnyi 355 103
17 @vladimir_dvorkin 343 156
18 @evgenyboginsky 329 40
19 @andrey_358 320 234
20 @apseregin 312 237
21 @npz 296 123
22 @ocanire 292 235
23 @yuriydanilevsky 279 100
24 @yaroslavmagazov 266 71
25 @kristinache____ 265 40
26 @denis_tishin 260 103
27 @evgeni_gerasimenko 249 82
28 @lenatara 246 154
29 @pratvmvmbrosvm 242 78
30 @fedascheva 235 54
31 @sergeystakanov 229 56
32 @kabanova_kristina 228 72
33 @tanniii66 217 124
34 @richardvashalomidze 211 142
35 @nelly_sivkova 203 103
36 @naturalist35087 201 91
37 @mediana 191 79
38 @alexander306 190 98
39 @kabanova_alina 188 47
40 @skuch 185 65
41 @aleks_989 184 39
42 @naturalist47177 184 39
43 @maks_12 181 21
44 @melodi_96 181 71
45 @tim_yako 180 74
46 @euronull 175 122
47 @olga_obedkova 175 66
48 @yanabykova09 175 49
49 @papikyashik 170 52
50 @nekotyan 168 78
51 @denis_shilov 165 119
52 @andrewins 164 62
53 @gerda_art 154 97
54 @jorushka 152 110
55 @uliana2002 148 71
56 @naturalist47004 147 25
57 @pavloviv 143 116
58 @velibortravoved 141 59
59 @naturalist29573 138 46
60 @stepangrebnev2005 137 92
61 @naturalist25051 135 85
62 @ann536 134 42
63 @artemperepelkin 131 95
64 @sansansusan 129 54
65 @shevdi 129 115
66 @bubany 126 49
67 @dni_catipo 124 57
68 @naturalist23374 123 86
69 @naturalist51320 123 73
70 @wronglog 123 36
71 @eugene_bagrov 119 71
72 @olgademina 119 72
73 @m_a_r_i_y_a 117 48
74 @zark0n 117 103
75 @linka_khvist 112 60
76 @mdkt 112 72
77 @vladimirkurilo 112 89
78 @gerda_new 111 19
79 @annasatanovskaya 110 30
80 @aleksandr_levon 109 82
81 @cvetlana 109 75
82 @tatyanazarubo 109 48
83 @svetlana_koveshnikova 108 55
84 @naturalistnatalie 107 89
85 @sasha2006 107 23
86 @sokolkov2002 105 44
87 @fyodorkhomenko 103 90
88 @tatyanapopova 102 34
89 @vera124 102 70
90 @a_ma_bird 101 71
91 @anastasiaak 101 56
92 @const 100 72
93 @minivi 100 87
94 @rysikovaaliina 100 61
95 @ermolenko_evelina_olegovna 99 50
96 @yurii_basov 99 57
97 @alzov 96 44
98 @kappagawa 95 56
99 @olegus 95 8
100 @oluny 95 72
101 @naturalist16000 94 48
102 @naturalist29789 94 41
103 @mogilevich 93 40
104 @natashamarch 93 41
105 @nellysemenova 91 44
106 @elizaveta_sheripova 90 32
107 @yana_zlochevskaya 90 61
108 @anastasia_surkova 89 45
109 @annakraynova812 89 37
110 @dmitrybabaev 89 56
111 @eugenezakharov 89 49
112 @naturalist_asey25 89 40
113 @supernadya 89 72
114 @anatoliy_bondarenko 87 41
115 @permyakov_artur 87 53
116 @annie3brushes 86 77
117 @iwan_soboliew 86 54
118 @cmrico 85 27
119 @geo_logos 85 21
120 @borisbolshakov 84 57
121 @ivkach 84 34
122 @lizaveta03 83 39
123 @olgakrilova 81 45
124 @naturalist41466 80 55
125 @velokanash 80 36
126 @woodmen19 80 42
127 @ikskyrskobl 79 32
128 @alena2000 78 59
129 @marina1214176 78 47
130 @daria1813 77 27
131 @o_talanceva 77 48
132 @tn61 77 33
133 @tverdyixleb 77 31
134 @gurkovlad 76 49
135 @k-i-r-i-l-l 76 45
136 @tatiana_ganina 76 33
137 @tutormax 76 40
138 @verba 76 58
139 @veronika1111 76 40
140 @rita161rus 75 36
141 @naturalist31340 74 42
142 @robleng292 74 57
143 @yuriysokolov73 74 47
144 @svetlana-bogdanovich 73 50
145 @yanasemour 73 27
146 @sergey2020 72 43
147 @dashakudr15 71 31
148 @yuriy21 71 27
149 @alinanat 70 42
150 @galina_karpova 70 20
151 @agsidenko 69 29
152 @anna_ymark 69 45
153 @ivanova37372 69 49
154 @dinasafina 68 43
155 @naturalist4690 68 33
156 @timakuzin 68 56
157 @vaglazunov 68 44
158 @zibzap 68 44
159 @alopecurus 67 46
160 @elementlu 67 47
161 @flankermarker 67 21
162 @egorca 66 24
163 @eriksultan_svg 66 17
164 @mike_a_kulik 66 44
165 @tomegatherion 66 38
166 @zmeykasofi 66 36
167 @alebedev 65 41
168 @ami_lena 65 44
169 @annastikhina 65 52
170 @maxim_ismaylov 65 16
171 @semantika2 65 55
172 @zlata_shevtsova 65 26
173 @helg168bov 63 45
174 @katerina_kashirina 63 39
175 @naturalist41126 63 29
176 @sabinamaksimova 63 52
177 @sergeyus 63 23
178 @svetlanarogatykh 63 32
179 @taria 63 41
180 @gypsy_moth 62 31
181 @natalia_tyumen 62 44
182 @naturalist37384 62 33
183 @sergiusstrit 62 35
184 @smirnovaab 62 57
185 @aagladilin 61 41
186 @anyuta 61 32
187 @jokshanuuk 61 47
188 @ninacourlee 61 36
189 @victoriazhatova 61 44
190 @allaverkhozina 60 30
191 @anastasiya_afonina 60 23
192 @katanihona 60 34
193 @maglove 60 35
194 @mitiko_ann 60 57
195 @titova_tasya 60 49
196 @globert 59 33
197 @irinashalisko 59 47
198 @lidia241985 59 26
199 @margosha 59 41
200 @alena_golovchenko 58 21
Anotado en 10 de septiembre de 2021 a las 05:15 PM por apseregin apseregin | 2 comentarios | Deja un comentario

12 de septiembre de 2021

Финал Кубка: новости второго дня

Дорогие друзья!

В 0:00 часов по местному времени 11 сентября стартовали финал и матч за третье место Командного кубка России по фотофиксации растений 2021 года. Участвуют 4 региональных проекта "Флоры России".

Брянская область и Калужская область сражаются за третье место, а Крым и Курская область разыгрывают финальный матч! Всё внимание на табло. Не забывайте: на этом этапе в зачёт будут идти только наблюдения подписчиков соответствующих региональных биоблицев.

Командный кубок России по фотофиксации дикорастущих растений на платформе iNaturalist - крупнейшее событие нашего сообщества. Так, только за один первый день 1/16 финала (14 августа 2021 г.) был поставлен суточный рекорд по числу наблюдений из России. В этот день было сделано 21,4 тыс. наблюдений, в том числе 17,8 тыс. наблюдений сосудистых растений.

Итоги второго дня таковы. На 21:00 MSK 12 сентября 2021 г. были загружены 1 180 наблюдений по 536 видам от 8 наблюдателей, попадающие в зачёт Командного кубка России по фотофиксации растений 2021 года. Что ж, посмотрим, что будет завтра и во вторник. Всем удачных стартов!

Официальный протокол:

НАБЛЮДЕНИЯ

Позиция Проект Количество
1 Крым, финал Кубка-2021 650
2 Брянская область, матч за 3-е место Кубка-2021 530
3 Калужская область, матч за 3-е место Кубка-2021 0
4 Курская область, финал Кубка-2021 0

ВИДЫ

Позиция Проект Количество
1 Крым, финал Кубка-2021 276
2 Брянская область, матч за 3-е место Кубка-2021 275
3 Калужская область, матч за 3-е место Кубка-2021 0
4 Курская область, финал Кубка-2021 0

УЧАСТНИКИ

Позиция Проект Количество
1 Брянская область, матч за 3-е место Кубка-2021 4
2 Крым, финал Кубка-2021 4
3 Калужская область, матч за 3-е место Кубка-2021 0
4 Курская область, финал Кубка-2021 0

НАБЛЮДАТЕЛИ

Место Наблюдатель Наблюдений Видов
1 @lenatara 183 127
2 @panasenkonn 140 112
3 @disertinsky 126 100
4 @svetlana-bogdanovich 186 87
5 @katerina_kashirina 222 87
6 @kiramarch 156 83
7 @alina_klu 108 68
8 @cambala 59 48
Anotado en 12 de septiembre de 2021 a las 06:12 PM por apseregin apseregin | 5 comentarios | Deja un comentario